La NSF vient d’attribuer 14 millions de dollars de financements pour faire avancer la génomique des plantes d’importance économique majeure aux Etats-Unis. Ce programme de génomique comparée vient compléter le programme sur le génome des plantes de la NSF démarré en 1998.
L’objectif est de développer les ressources génomiques indispensables à l’interprétation de la structure, de la fonction et de l’évolution des génomes des plantes d’intérêt économique majeur. En pratique, les séquences génomiques, les marqueurs génétiques et les cartes génomiques établis serviront à l’amélioration variétale mais aussi à faire avancer les connaissances sur l’évolution des plantes cultivées (polyploïdie, phénomène de spéciation, relations espèces cultivées – adventices).
Parmi les projets sélectionnés, un groupe mené par Washington University à Saint Louis a reçu 1,12 million de dollars pour se consacrer à l’étude du génome du riz rouge (riz sauvage) pour élucider son origine et les différences moléculaires avec le riz cultivé. Le riz sauvage est l’adventice la plus néfaste pour les plantations de riz. Elle affecte considérablement les rendements et contamine les récoltes commerciales et les semences. La lutte contre cette "mauvaise herbe" est compliquée du fait qu’il s’agit de variétés très voisines des riz cultivés et donc sensibles aux mêmes herbicides.
D’autres projets sont consacrés aux impacts de la polyploïdie sur les crucifères comme le colza et les choux de Bruxelles (University of Missouri), à la cartographie du génome de cotons di- et tétra-polyploïdes (Iowa State University) ou encore à la variabilité génétique chez le pin (UC Davis) et le Maïs (Cornell).
Source :
– Présentation du programme Plant Genome Comparative Sequencing Program (PGCSP) :
https://www.nsf.gov/news/news_summ.jsp?cntn_id=108263&org=olpa&from=news
– Annonce des projets sélectionnés par la NSF
https://www.nsf.gov/news/news_summ.jsp?cntn_id=108263&org=olpa&from=news
Pour en savoir plus, contacts :
– Liste des projets sélectionnés et liens vers leur descriptif :
https://www.nsf.gov/bio/pubs/awards/pgcsp.htm
– Présentation du programme Plant Genome Research Program (PGRP) :
https://www.nsf.gov/funding/pgm_summ.jsp?pims_id=5338
– National Plant Genome Initiative 2003-2008 :
https://www.ostp.gov/NSTC/html/npgi2003/index.htm
– Projet riz rouge de Washington University :
https://news-info.wustl.edu/tips/page/normal/8054.html
– Le riz rouge, FAO :
https://www.fao.org/docrep/006/Y5031E/y5031e09.htm
Code brève
ADIT : 41086
Rédacteur :
Claire Notin, [email protected] – Jean-Pierre Toutant, [email protected]
