La conception de molécules basée sur des informations structurales est promise à de grands développements. Une approche plus rationnelle, avec des outils élaborés et des techniques largement enseignées contribuent au développement de molécules actives dites ‘SBDD’.
A court terme, l’utilisation de la structure cristallographique des protéines combinées à de nouveaux outils bioinformatiques dédiés à la conception de molécules actives est un moyen essentiel pour caractériser de nouveaux médicaments plus efficaces et raccourcir leur cycle de développement avec une réduction des coûts pour les laboratoires pharmaceutiques. Une importante synergie académie-industrie, avec une attention croissante accordée aux applications thérapeutiques en particulier par les laboratoires de biologie structurale académiques, est une condition préalable au succès de l’approche ‘SBDD’.
Ce document a pour but de :
– Décrire les développements technologiques de la biologie structurale et ses applications en recherche pharmacologique.
– Mettre en évidence les potentialités de ce domaine d’activité, en particulier dans le contexte des interactions entre la recherche académique et le secteur industriel.
Au sommaire de ce document :
1. "Structure Based Drug Design" : une approche essentielle pour accélérer la caractérisation de nouvelles molécules thérapeutiques. Définitions et enjeux
1.1. Les protéines : principales cibles thérapeutiques
1.2. La caractérisation de molécules thérapeutiques : les approches traditionnelles
1.3. La caractérisation de molécules thérapeutiques à l’ère postgénomique
1.4. Les développements de la biologie structurale apportent une nouvelle dimension dans la caractérisation de molécules thérapeutiques
2. Les outils du "Structure Based Drug Design"
2.1. Obtention d’une protéine purifiée
2.2. Analyse structurale
– Analyse structurale par la cristallographie
– La Résonance Magnétique Nucléaire (‘RMN’)
– La spectrométrie de masse
– La cryomicroscopie électronique
2.3. Résolution de la structure et construction d’un modèle, dans le cas des rayons X
2.4. Exploitation des modèles pour la conception et/ou l’amélioration d’un ligand : les outils du "docking" structural
3. "Structure Based Design" : quelques exemples d’application et perspectives
3.1. Les réalisations et développements récents dans le domaine
3.2. Quelques grandes familles fonctionnelles de protéines bénéficiaires de cette approche
3.3. Perspectives
4. Les intervenants économiques dans la démarche ‘SBDD’
4.1. Les laboratoires académiques
4.2. Les grands instruments financés par les fonds publics
4.3. Les entreprises pharmaceutiques
4.4. Les entreprises biotechnologiques
5. Conclusion
Annexes :
– Structure des protéines : caractéristiques et déterminants
– Liste de sociétés engagées dans une activité liée au "Drug Design"
– Références
Auteurs : RENUCCI Armand
Publié le 1/06/2006 – 53 pages – pdf 1,1 Mo
